โรงเรียนคูเต่าวิทยา สังกัดสำนักงานคณะกรรมการการศึกษาชั้นพื้นฐาน กระทรวงศึกษาธิการ ตั้งอยู่ ๑๒๖ หมู่ที่ ๘ ตำบลคูเต่า อำเภอหาดใหญ่ จังหวัดสงขลา ประกาศตั้งเมื่อวันที่
๓๐ มีนาคม ๒๕๒๗ โดยขอใช้ที่ดินสาธารณประโยชน์จำนวน ๔๓ ไร่ ๓ งาน ๑๒ ตารางวา เปิดสอนครั้งแรกแบบสหศึกษา เมื่อวันที่ ๑๖ พฤษภาคม ๒๕๒๗ นักเรียนชั้นมัธยมศึกษาปีที่ ๑ จำนวน ๓ ห้องเรียน มีนักเรียนจำนวน ๑๓๘ คน แต่เนื่องจากยังไม่มีอาคารของโรงเรียนจึงอาศัยเรียนที่โรงเรียนวัดดอนและศาลาการเปรียญวัดดอน
โดยมีผู้อำนวยการโรงเรียนหาดใหญ่วิทยาลัย (นายธรรมนูญ วิสัยจร) เป็นผู้รักษาการในตำแหน่งครูใหญ่ และได้ครู-อาจารย์จากโรงเรียนวัดดอนและโรงเรียนหาดใหญ่วิทยาลัยมาช่วยทำการสอนในระยะแรก ต่อมาในปีการศึกษานั้นเอง กรมสามัญศึกษาได้บรรจุแต่งตั้งครู-อาจารย์ให้กับโรงเรียนจำนวน
๕ คน
วันที่ ๑๑ มิถุนายน ๒๕๒๗ อาคารเรียนชั่วคราวซึ่งประชาชนตำบลคูเต่าและตำบลใกล้เคียงตลอดจนผู้มีจิตศรัทธาจากภายนอกได้ร่วมกันบริจาคทรัพย์ในการสร้างเสร็จเรียบร้อย จึงได้ย้ายนักเรียนจากโรงเรียนวัดดอนมาเรียนที่โรงเรียน
และได้ทำพิธีเปิดในวันที่ ๒๙ กรกฎาคม ๒๕๒๗ โดยรัฐมนตรีว่าการกระทรวงศึกษาธิการ ฯพณฯ นายชวน หลีกภัย เป็นประธาน
วันที่ ๑๑ มิถุนายน ๒๕๒๗ อาคารเรียนชั่วคราวซึ่งประชาชนตำบลคูเต่าและตำบลใกล้เคียงตลอดจนผู้มีจิตศรัทธาจากภายนอกได้ร่วมกันบริจาคทรัพย์ในการสร้างเสร็จเรียบร้อย จึงได้ย้ายนักเรียนจากโรงเรียนวัดดอนมาเรียนที่โรงเรียน
และได้ทำพิธีเปิดในวันที่ ๒๙ กรกฎาคม ๒๕๒๗ โดยรัฐมนตรีว่าการกระทรวงศึกษาธิการ ฯพณฯ นายชวน หลีกภัย เป็นประธาน วัน
ที่ ๒๒ มิถุนายน ๒๕๒๗ นายมานพ จันทรักษ์ ได้รับคำสั่งแต่งตั้งจากกรมสามัญศึกษา ให้มาดำรงตำแหน่งครูใหญ่โรงเรียนคูเต่าวิทยา
วันที่ ๒๒ กรกฎาคม ๒๕๒๗ เกิดวาตภัยขึ้นในท้องที่ตำบลคูเต่าและตำบลใกล้เคียง ทำให้บ้านเรือนราษฎรเสียหายพร้อมกันนี้อาคารเรียนชั่วคราวของโรงเรียนที่เพิ่งสร้างเสร็จก็ประสบวาตภัยพังทะลายลงมาทั้งหลังด้วย
วันที่ ๒๓ กรกฎาคม ๒๕๒๗ จึงได้ย้ายนักเรียนกลับไปที่โรงเรียนวัดดอน อีกครั้ง
วันที่ ๒๙ กรกฎาคม ๒๕๒๗ ฯพณฯ รัฐมนตรีว่าการกระทรวงศึกษาธิการ (นายชวน หลีกภัย) ได้เดินทางมาเยี่ยมให้กำลังใจ และสนับสนุนการก่อสร้างอาคารเรียนชั่วคราวขึ้นมาใหม่แทนหลังเก่าโดยมี
ผู้มีจิตศรัทธาให้การช่วยเหลือผ่าน ร.ต.ปรียา กุลมัย นายอำเภอหาดใหญ่สมัยนั้น จนถึงวันที่ ๗ กันยายน ๒๕๒๗ อาคารชั่วคราวหลังใหม่สร้างเสร็จเรียบร้อยจึงได้ย้ายนักเรียนกลับมาเรียนจนถึงปัจจุบัน